La sobriété de l’édifice illustre l’idéal de pauvreté de cet ordre. En 1331, Saint-Guillaume devient la paroisse des corporations des bateliers et des pêcheurs comme en témoigne l’ancre qui orne la pointe du clocher.

Le culte protestant y est célébré à partir de 1534. Le monastère attenant abrite désormais l’internat de la Haute école