La FAMIS est composée des institutions suivantes :
- le Mont des Oiseaux près de Wissembourg (67)
- l’Association Fraternelle Mennonite et l’Association Servir à Valdoie (90)
- l’Association des Etablissements du Domaine Emmanuel, dont le siège est à Hautefeuille (77)
- la Fondation des Amis de l’Atelier, dont le siège est à Châtenay-Malabry (92)